С точки зрения логики, теги - это конкуренты номерам карточкек. Вводя их, мы строим новые деревья, спускаясь по которым быстрее находим нужные карточки:
Ссылки же, это связи “поперек” номеров. То есть не по смыслу группы (как Вы правильно заметили), к которой принадлежит карточка, а индивидуально.
Т.е. вы предпочитаете одно другому в зависимости от того, хотите ли вы получить “ожидаемую” информацию (что ищу, то и получаю) или “неожиданную” (искал одно, а вышел на другое).